一、檢查部門

高企認定主管部門：科技、財政、稅務(wù)部門，其他相關(guān)部門：環(huán)保、質(zhì)量/安監(jiān)、審計等部門。

二、檢查要點

科技部門

1.技術(shù)領(lǐng)域是否屬于管理辦法或工作指引中的領(lǐng)域

2.專利權(quán)屬及專利時效確認

3.主要產(chǎn)品（服務(wù)）收入占高新收入比例是否超過50％

4.申報前后各期數(shù)據(jù)對比及與高新年報數(shù)據(jù)對比

5.申報材料各項指標核對

三、財政部門

1.每年定期對承擔高企審計的事務(wù)所進行底稿等風險檢查，并抽選部分企業(yè)進行延伸檢查

2.會計師事務(wù)所行業(yè)協(xié)會自律檢查。

四、稅務(wù)部門

1.申報材料與稅務(wù)申報數(shù)據(jù)是否有沖突

2.高企認定稅收優(yōu)惠備案檢查

3.研發(fā)費用加計扣除備案檢查

4.其他相關(guān)稅務(wù)檢查

五、環(huán)保部門

1.是否存在環(huán)評風險

2.是否存在嚴重環(huán)境違法行為

質(zhì)量/安監(jiān)部門    

是否存在重大質(zhì)量、重大安全事故

六、審計部門

1.針對行政公職人員瀆職、受賄等違法行為的延伸檢查

2.國有企業(yè)自身的定期審計檢查

企業(yè)備查資料

（1）知識產(chǎn)權(quán)證書

（2）科技成果轉(zhuǎn)化證明材料

（3）研發(fā)活動證明材料

（4）研發(fā)費用明細賬及相關(guān)憑證

（5）高新收入證明材料

（6）科技人員證明材料

（7）產(chǎn)學研合作證明材料

（8）檢查部門要求的其他資料

高新技術(shù)企業(yè)稅收優(yōu)惠資格有效期為三年，許多企業(yè)重視申報，忽視資格維持，從而帶來潛在的稅務(wù)風險。根據(jù)《高新技術(shù)企業(yè)認定管理辦法》要求，“科技部、財政部、稅務(wù)總局應(yīng)建立隨機抽查和重點檢查機制，加強對各地高新技術(shù)企業(yè)認定管理工作的監(jiān)督檢查?！币虼耍髽I(yè)不僅要重視認定時資料的準備，更應(yīng)當注重資格維持，為期滿后重新認定及后續(xù)可能面臨的檢查做好充分準備。